بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو Cox2 انسانی

Authors

  • اشتری, پرویز پژوهشگاه علوم و فنون هسته‌ای
  • رمضانی, علی دانشگاه علوم پزشکی زنجان
  • موسوی, سیده فاطمه دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج
Abstract:

مقدمه: مهار‌کننده‌ های انتخابی آنزیم سیکلو‌اکسیژناز دو، نظیر سلوکو‌کسیب، روفوکوکسیب و والدوکسیب اخیراً به عنوان کاهنده‌ های پاسخ‌ های التهابی به کار می ‌روند، با وجود این هنوز به مطالعات و تحقیقات بیشتری در زمینه مهار‌کننده‌ های انتخابی Cox2 نیاز است. این مطالعه در راستای معرفی ساختار‌های جدید با میل تر‌کیبی بیشتر به آنزیم Cox2 می ‌‌‌باشد. مواد و روش ها: سا‌ختار‌های شیمیا‌یی با 80 درصد شباهت به سلو‌کو‌کسیب، از Pubchem در پایگاه اطلاعا‌تی NCBI استخراج و جمع ‌‌آوری شد. فایل PDB آنزیم Cox2 (6COX) را د‌ر حا‌لت پیوند با لیگا‌ند SC-558 به عنوان لیگاند مرجع، از سایت RCSB PDB به دست آمد. د‌اکینگ لیگا‌ند‌ها به جایگاه اتصال SC-558 را با استفاد‌ه از نرم افزار FlexX, Lead IT اجرا شد و انرژی میان کنش‌ های بین ترکیبات مختلف به دست آمد. مقدار IC50 ترکیبات مورد نظر با استفاده از روش غربالگری آزمایشگاهی، بر علیه آنزیم Cox2 تعیین شد. سرانجام با استفاده از روش سنجش MTT‌، میزان سمیت سلولی ترکیبات مورد نظر تعیین شد. یافته های پژوهش: نتیجه غربالگری در پایگاه داده Pubchem، 5000 مولکول مشابه سلوکوکسیب بود. 24 تا از ترکیبات امتیاز‌های انرژی بهتری نسبت به 6COX باند شده با SC-558 داشتند. لیگاند‌ها به پاکت پیو‌ند‌ی داک شد‌‌ند که با سرین 353، آلانین 527، وا‌لین 523، متیونین 522، فنیل آلانین 518 و لوسین 352 میان کنش نشان د‌اد‌ند. با بررسی چشمی، ترکیبات جهتگیری و حالت پیوندی مشابه با SC-558 نشان داد‌‌ند.  بحث و نتیجه گیری: یافته ‌های ما، رویه محاسباتی کشف ترکیبات جدید ضدالتهابی با فعالیت بیشتر و سمیت کمتر نسبت به مهارکننده‌ های عمومی Cox2 را قوت بخشید.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو cox۲ انسانی

مقدمه: مهار کننده های انتخابی آنزیم سیکلو اکسیژناز دو، نظیر سلوکو کسیب، روفوکوکسیب و والدوکسیب اخیراً به عنوان کاهنده های پاسخ های التهابی به کار می روند، با وجود این هنوز به مطالعات و تحقیقات بیشتری در زمینه مهار کننده های انتخابی cox2 نیاز است. این مطالعه در راستای معرفی ساختار های جدید با میل تر کیبی بیشتر به آنزیم cox2 می باشد. مواد و روش ها: سا ختار های شیمیا یی با 80 درصد شباهت به سلو کو ک...

full text

بررسی آزمایشگاهی اثر سمیّت سلولی داروهای مهارکننده آنزیم سیکلواکسیژناز (COX1, COX2) بر روی رده سلول KB

بررسی آزمایشگاهی اثر سمیّت سلولی داروهای مهارکننده آنزیم سیکلواکسیژناز (COX1, COX2) بر روی رده سلول KB دکتر مریم السادات هاشمی پور1- هدی مهرابی‌زاده هنرمند2- فریده فلسفی2 - سعید رجبعلیان3 - رفعت حسینی4 1- استادیار گروه آموزشی بیماریهای دهان و تشخیص دانشکده دندانپزشکی و مراکز تحقیقاتی علوم و اعصاب و بیماریهای دهان و دندان دانشگاه علوم پزشکی کرمان2- دانشجوی دندانپزشکی3- کارشناس ارشد بیولوژی مولکول...

full text

اندازه گیری فعالیت آنزیم الاستاز

Statement of Problem: Changes in protein levels, host calls enzymes and inflammatory mediators in gingival crevicular Fluid (GCF) are considered as diagnostic indicators of Periodontitis.Purpose: he aim of the present study was to measure the elastase enzyme activity in gingival crevicular Fluid among patients with periodontitis.Material and Methods: In this study, 52 periodontitis patients (ex...

full text

یک روش ساده برای اندازه گیری هیستامین و فعالیت آنزیم هیستیدین دکربوکسیلاز در مغز موش آزمایشگاهی

The content of the histamine in most mammalian tissues is very low.    Thus , presentation a simple and sensitive method to assay the histamine    content in crude extracts tissues is required .           In this work ,we presented a simple method for the measurement of the    histamine. 2 mg of rat brains was ho...

full text

اندازه گیری فعالیت آنزیم نیترات ردوکتاز در سیب گلدن دلیشس

این تحقیق طی سالهای 74-1372 در محل گلخانه ها و آزمایشگاههای تحقیقاتی گروه باغبانی دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران بر روی نهال های سیب رقم گلدن دلیشس پیوند شده روی پایه مالینگ 9 انجام شده است . در این آزمایش گیاهان دو ساله (مالینگ 9) در تاریخ 12/1/72 در گلدانهایی به ابعاد 26*28 سانتی متر ودر بستر ماسه و پرلایت در گلخانه کشت گردیدند . این بررسی در قالب یک طرح آزمایشی فاکتوریل با پایه کاملا تصادفی ب...

full text

اندازه گیری فعالیت آنزیم سیالیل ترانسفراز و اثرات عمل فسفریلاسیون و دفسفریلاسیون بر فعالیت آن در مغز موش آزمایشگاهی

مقدمه: گزارش های قبلی نشان می دهد که مکانیزم فسفریلاسیون و دفسفریلاسیون در تنظیم فعالیت آنزیم سیالیل ترانسفراز دخالت دارند. در این پژوهش هدف بررسی تغییرات فعالیت آنزیم سیالیل ترانسفراز از طریق مکانیسم فسفریلاسیون و دفسفریلاسیون است. مواد و روش ها: پژوهش حاضر بر روی 25 موش آزمایشگاهی انجام شد. مغز موشها را بیرون آورده و هموژنه مغز تهیه شد. جدا سازی آنزیم سیالیل ترانسفراز مغز موش آزمایشگاهی در کر...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 23  issue 3

pages  97- 108

publication date 2015-09

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023